Al final de La comunidad del anillo, muerto Boromir y desaparecido Gandalf en el Puente de Khazad-dûm, la Comunidad se vio obligada a dividirse en tres grupos. Sin embargo, esta disolución no ha socavado la firmeza de ninguno de sus miembros para seguir su heroica misión en Las dos torres, la segunda entrega de El señor de los anillos.

Perdidos en las colinas de Emyn Muil, Frodo (Elijah Wood) y Sam (Sean Astin) descubren que alguien les sigue: el misterioso Gollum (Andy Serkis). Esta inquietante criatura corrompida y deformada por el Anillo, promete, a cambio de su liberación, guiar a los hobbits hasta las Puertas Negras de Mordor. Sam no confía en su nuevo acompañante, pero Frodo se apiada de Gollum porque también ha sido, como él, Portador del Anillo.

En otro punto de la Tierra Media, Aragorn (Viggo Mortensen), el arquero elfo Legolas (Orlando Bloom) y Gimli el enano (John Rhys-Davies) llegan al atormentado Reino de Rohan. El lugar es gobernado por el antaño glorioso rey Théoden (Bernard Hill), quien, manipulado ahora por el siniestro espía Gríma Lengua de Serpiente (Brad Dourif), ha caído bajo el hechizo maligno del mago Saruman. En Rohan también habita Éowyn (Miranda Otto), la sobrina del rey que ve al guerrero Aragorn como un posible líder... y aunque éste se siente atraído por la hermosa Éowyn, no puede olvidar el amor que le une a la elfa Arwen (Liv Tyler) y el pacto que hicieron los dos.

Tras el devastador duelo que mantuvo con el Balrog en la primera parte de El señor de los anillos, Gandalf (Ian McKellen) renace bajo la forma de Gandalf el Blanco y recuerda a Aragorn que su destino es hermanar el Reino de Rohan con la ayuda del último bastión de resistencia humana que queda: el pueblo de Gondor.

Entretanto, los hobbits cautivos Merry (Dominic Monaghan) y Pippin (Billy Boyd) escapan de los uruk-hai por sus propios medios y llegan al misterioso bosque de Fangorn, entre cuyos vetustos árboles encuentran a un aliado inesperado, Bárbol -un inquietante ser, mitad hombre mitad árbol- que les cuenta que el bosque ha sido arrasado por Saruman.

En trayectos paralelos, los distintos miembros de la Comunidad se enfrentarán a ejércitos descomunales y maléficas traiciones, serán testigo de asombrosos acontecimientos y comprobarán hasta dónde llega la sensacional fuerza de los habitantes de la Tierra Media. Juntos deberán contener a las poderosas fuerzas del Mal que ya se despliegan desde las dos torres: la Torre de Orthanc en Isengard, donde el perverso mago Saruman ha formado un ejército mortífero de diez mil soldados, y la Torre de Barad-dûr, fortaleza de Sauron erigida en el corazón de la sombría tierra de Mordor...

En Las dos torres aparecen nuevos y fascinantes personajes:
-Gollum: después de su fugaz aparición en la primera parte, donde seguía los pasos a los miembros de la Comunidad, este misterioso personaje sale a la luz para intervenir decisivamente en la misión de destruir el Anillo.
-Los habitantes de Rohan: entre otros, la hermosa Éowyn, su hermano Éomer, Théoden (el rey engañado) y Gríma Lengua de Serpiente (el consejero traidor de Théoden y espía de Saruman en el Reino de Rohan).
-Faramir, hombre de Gondor y hermano del asesinado Boromir.
-El ent Bárbol, un árbol vivo, considerado uno de los seres más antiguos de la Tierra Media.