Kejsaren och mördaren utspelar sig på 200-talet före Kristus och är berättelsen om den ärelystne Kungen av Qin som är besatt av tanken på att förena hela Kina och bli dess förste kejsare. För att nå dit använder han terror och våld mot allt som kan tänkas stå mellan honom och hans mål. För att på något sätt bidra till kungens drömmar om ett enat Kina iscensätter Lady Xhao (hans älskade sedan barndomen ) en intrikat men falsk mordkomplott mot honom. Men innan planen är genomförd upptäcker kungen en smärtsam hemlighet om sin födelse och detta hemska avslöjande väcker hans grymma instinkter till liv.